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Lo scopo dell’esistenza di un’area protetta è la conservazione dell’ambiente e della flora e fauna che vi abitano. La riserva marina di Miramare si è sempre fatta portavoce di una politica di sperimentazione di sistemi alternativi di studio dell’ambiente marino, e la ricerca si è avvalsa di strumenti non invasivi.
Negli anni si sono utilizzate tecnologie e strumenti sempre più sofisticati per investigare e preservare l’area in esame.

Dal 1989 l'area protetta utilizza il visual census come tecnica di censimento delle specie ittiche mediante osservazioni dirette con video camera subacquea o semplice osservazione in situ; in anni più recenti sono state introdotte tecniche di indagine acustica, passiva ed attiva,con l'utilizzo idrofoni ed ecoscandaglio inoltre dal 1992 la riserva marina conduce un programma di monitoraggio chimico - fisico supportato dalla presenza di una boa oceanografica

 

 

 
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